Un siglo después, y Treona sigue siendo una nación libre y próspera... O eso es lo que uno espera. La república Treana está a punto de realizar cambios en sus líderes, y eso lleva a que todas las fuerzas en la nación se intenten hacer con el poder. Al mismo tiempo, Marcel Hyfrun está a punto de terminar sus clases en la Academia de Chrom, pero su destino cambia al completo una vez destapa un gran secreto en la academia, llevándolo a una fuerza mayor que toda la nación.