Dans un village japonais reclus des années 2000, le jeune Ichirō pleure sa sœur Hisako, mystérieusement décédée. En découvrant son journal intime, il y trouve d'étranges symboles cryptés qu’on retrouve également partout dans le village. Aidé par Kagome, une internée de la maison de soins, et par son propre père, Netero, Ichirō entame une enquête clandestine pour décoder cet alphabet, persuadé qu’il détient la clé de ce qui est arrivé à sa sœur. Ils découvrent alors la terrifiante vérité.