L'histoire se déroule dans un monde où la magie est omniprésente. Notre protagoniste nommé 9 est emprisonné dans une mystérieuse prison dont personne n'a jamais réussi à s'échapper. Cette prison appelée Chronos est connue pour sa capacité à manipuler le temps lui-même. 9 est doté d'un pouvoir spécial : il peut absorber les pouvoirs magiques des autres prisonniers. Malheureusement les gardiens de Chronos ont enfermé des criminels puissants et dangereux qui possèdent des dons magiques uniques.