這是一個有光與黑暗共存的世界，人類象徵著光，但有個詛咒打破人類的生活，生下的嬰兒是沒有任何的抗體的，讓嬰兒快速死亡，這個問題導致人類無法有後代，這時有一所名為魔藥學院的校長，解決了這問題，讓人類重回光的懷抱，故事也是在這學院開始的。 芙羅納和洛陽，是在學院教導屬於黑暗的小影子們，只要學習能力出色的小影子，被學院認可就能回到親生父母的疼愛，這是一件快樂的事每個小影子們都希望能回到原來的家，就像醜小鴨找回原來的家一樣，這一切原本大家都過著平凡的生活。 直到有一天主角兩人，因為太無聊準備趁晚上準備去探險，那是一直不能靠近的魔藥實驗室，發現這所學院裡和這世界對小影子們是多麼的不公平又殘酷的事實，而為了讓一起陪伴成長的小影子們活下去，主角兩人帶領著小影子們逃出對他們來說不公平的牢籠。 逃出學院以後，主角兩人跟小影子們來到學院都不允許任何人進入的危險魔藥森林，而這意味著以前那個快樂時光不復存在，他們再次跨出勇氣，尋找那條活下去的道路，居然發現之前在學院裡故事書有記載的糖果屋，遇到了學院裡失蹤已久的人，漸漸又更了解這世界的真相，打算打破這不公平的對待，為小影子們戰鬥，打出屬於小影子們全新道路。